希鲁鲁克暗中恳求朵丽儿医娘收留乔巴，朵丽儿医娘原先以为希鲁鲁克在开玩笑而将他赶出去，事后她却发现似乎有些不对劲，并赶到希鲁鲁克家时，家中只剩下乔巴在休养，希鲁鲁克为医治生病的“医生20”已经动身前往磁鼓国的城堡，乔巴得意洋洋的拿出阿密乌菇，告诉朵丽儿医娘他用这个治好了希鲁鲁克的恶疾，反被狠狠训了一顿，原来乔巴历经千辛万苦找到的“阿密乌菇”，其实是一种剧毒菇。地址失效发送任意邮件到 ltxs Ba@gmail.com 获取最新地址希鲁鲁克明知道乔巴弄错了，但为了感谢他的心意以及不忍心让他失望，明知道是剧毒菇仍然喝下了阿密乌菇煮成的汤，因此反而缩短了他的性命，使得原本不到10天的寿命缩短只剩下半天可活。希鲁鲁克赶到城堡后，发现医生20生病的消息是磁鼓国国王瓦尔波设下诱捕的陷阱，但他为此对国家没发生任何大事感到相当高兴，他深信自己就算死了也能够医治国家的恶疾，随后大喊著“我的人生……真是的太美好了”并饮下装设炸弹的酒自杀身亡，瓦尔波看到这样的结果，内心不但没任何惭愧之意，反而将希鲁鲁克的死视为一个大笑话，令目赌一切的乔巴相当震怒，于是冲向瓦尔波的军队打算和他们玉石俱焚，被瓦尔波的干部之一多尔顿给阻止。多尔顿为瓦波尔的所作所为跟乔巴道歉，也表示不希望再看到任何像希鲁鲁克一样为了国家和平而牺牲的人丧命，乔巴才终于打消为希鲁鲁克报仇的念头。希鲁鲁克过世后，乔巴继承了他的遗志，立志成为能够医治所有疾病的万能药，并向朵丽儿医娘学习医术。

初次登场

正在加载托尼.托尼·乔巴

乔巴的初次登场，是和库蕾哈医生一同到磁鼓岛的城镇“凯斯特”寻找病患的时候，后来因协助治疗感染病毒的娜美，及身受重伤的路飞和山治而首次接触草帽海贼团。在与病愈的娜美谈天时，乔巴流露出对海贼的憧憬，娜美因此邀请他以医生的身份加入，但他却以“自己是驯鹿，不能跟人类在一起”的理由推卸了。库蕾哈医生听到他们的对话，将乔巴的身世及想寻找伙伴的心结告诉娜美，并希望他们能治好他长久以来的“心病”。

路飞在打倒瓦尔波后，多次邀请乔巴加入成为伙伴(但路飞并不知道乔巴是医生，只因觉得他很有趣而已)，但乔巴的内心却一直交战着，反复认为自己是驯鹿所以没资格加入。经历一整天的“邀请”与“逃避”，路飞使尽最大的嗓子对乔巴喊叫：“少啰唆，跟我们走就是啦！”，这一喊不但冲走了乔巴的犹豫，也给予他出海的勇气。在向库蕾哈医生道谢以后，乔巴便随着草帽海贼团离开，并正式成为他们第六位伙伴。

乔巴的成长经过及加入草帽海贼团这段故事，曾被改编、重新制作成剧场版《one piece the movie 乔巴身世之谜：冬季绽放、奇迹的樱花》。

阿拉巴斯坦篇

阿乔巴与乌索普联手击败mr.4与miss圣诞节双人组，当路飞在祭葬殿击败了当时的王下七武海之一的沙·克洛克达尔之后，路飞利用自身的能力特性，将索隆与乔巴一起带回地表和其他人会合。而妮可·罗宾在前进梅丽号现身时，乔巴虽然一开始对罗宾有着几分畏惧，但因为罗宾利用“花花果实”的能力对路飞开玩笑，使得乌索普与乔巴跟着路飞起哄大笑之余，对罗宾也不再像先前那么顾忌。

空岛篇

乔巴战胜了四神官的涅盘，却接连败在四神官之一的欧姆和艾尼路手上。尔后在长环岛与福克西海贼团举办竞赛时，乔巴和罗宾一度因为被对方选定为俘虏的船员，使得两人只得在一旁观赛，索隆更因为乔巴被对方选走讲出的丧气话出言训斥他。由于路飞最后战胜了福克西，乔巴和罗宾顺利回归草帽海贼团。但后来草帽海贼团遇上了三大将之一的“青雉”库山展开决战不幸败北，路飞、索隆、罗宾、山治更因此遭到冻伤，乌索普与娜美协助乔巴将冻伤的四人带回前进梅丽号，而乔巴也在事后帮助四人处理冻伤的伤势。